밤의 여왕은 타미노 왕자에게 자신의 딸인 파미나 공주가 자라스트로라는 폭군에게 납치되었다며 구출을 도와달라고 한다. 타미노는 새잡이 파파게노와 함께 파미나를 구하기 위한 여정을 시작한다. 그들은 여왕이 건넨 마술피리의 도움으로 공주를 만나지만, 자라스트로가 여왕의 말과 달리 폭군이 아니고 철학자라는 사실을 알게 된다. 타미노 왕자는 그들의 일원이 되기 위해 침묵의 시험을 받게 되고, 공주는 말 없는 타미노를 오해하기 이른다.