소닉과 닥터 에그맨의 격돌로 산산이 조각난 우주. 이제 소닉은 여러 평행 차원을 질주하며 친구들과 다시 만나고 세상을 구해야 한다.

조각난 우주에서 오합지졸 친구들의 도움을 받으며 카오스 위원회와 대적하는 소닉. 과연 위원회를 제치고 강력한 패러독스 프리즘을 손에 넣을 수 있을까? 한 번에 하나씩, 파편부터 모아야 한다!