서니밸리라는 마을로 새로 이사 온 빌리는, 어느 날 마을 곳곳에서 기이한 현상을 목격한다. 마을에는 보통 사람들의 눈에 띄지 않는 '스푸키'라는 기묘한 괴물들이 있었고, 빌리는 동생 버트와 친구들과 함께 스푸키들을 추적하는 모험을 시작한다.

집으로 돌아간 스푸키들을 그리워하는 스푸키 크루. 알 수 없는 이유로 스푸키들이 다시 나타나자 스푸키 크루는 무슨 이유로 스푸키들이 집으로 돌아가기 싫어하는지 걱정한다. 그리고 결국 스푸키들이 두려워하는 존재가 공포의 차원에 있다는 사실을 알아내고 이 존재를 막기 위해 고군분투한다.