마법의 나라 쥬라이 헬름의 여왕 교체기. 여왕 후보는 2사람. 머릿속이 봄날인 츠나미, 그리고 쥬라이 헬름의 장래를 생각하는 라미아. 그리고, 최종 전형의 결과, 집정관들에 의해서 시기 여왕 후보로서 선택된 것은 츠나미였다. 그리고 그녀는 스스로의 자질을 집정관들에게 나타내기 위해서 여왕이 되기 위한 「최종 시련」을 받는 일이 된다. 이 시련이라는 것이 이세계 지구에 존재하는 영혼이 이어진 소녀에 마법의 힘을 주어 그 소녀가 마법의 힘을 어떻게 사용하느냐에 따라 여왕의 자질을 판단하는 것.[7] 한편, 자기가 여왕이 되지 못한 것에 대한 분노와, 츠나미에 대한 질투에 불타오르는 라미아는 자신과 영혼이 이어진 소녀를 이용해 츠나미의 여왕 등극을 방해하려 한다. 츠나미의 영혼이 이어진 소녀는 카와이 사사미. 라미아와 영혼이 이어진 소녀는 아마노 미사오. 평상시는 친한 친구인 두 명은 서로의 정체를 모르는 채, 각각 마법 소녀가 되어, 싸워 가게 된다……