마츠모토 레이지의 동명 만화를 원작으로 하고 있는 SF 해양 액션 애니메이션. 은하철도 999나 하록, 천년여왕 시리즈 등 마츠모토 레이지의 주요 작품들이 대부분 우주를 배경으로 하고 있던 것과 달리, 이 작품은 지구의 바다를 중심 배경으로 삼고 있는 것이 특징이다. 근미래의 일본을 배경으로 지구를 노리는 해양제국의 마수에 맞서 싸워 나가는 소년 스스무와 잠수함 수퍼99호를 중심으로 이야기를 펼쳐나가고 있다.