2199년 인류는 가미라스 제국과의 전쟁에서 패배하여 그들의 공격을 피해 지하도시로 내몰리게 되었다. 남은 생존 기간은 일년. 젊은 장교 코다이 스스무와 시마 다이스케는 화성에 불시착한 우주선으로부터 정체불명의 캡슐을 얻어 지구로 가져온다. 그안에는 인류의 마지막 희망이 들어 있었다. 마젤란 은하의 반대편에 가미라스를 물리치고 지구를 복구할 기술을 가진 이스칸다르 행성이 있다는 것이었다. 우주전함 야마토가 이 임무를 맏게 되었다. 이제 인류에게 남은 기간은 일년.
우주전함 야마토 시리즈의 첫번째 작품 우주전함 야마토의 리메이크판인 우주전함 야마토 2199의 후속 작품으로 우주전함 야마토 2의 리메이크작이다. 전작이 그랬듯이 7장으로 나누어서 극장 선공개를 한 뒤에 TVA 시리즈로 낼 것으로 예상된다. 시간적으로는 전작에서 3년 뒤인 2202년 을 다루고 있다. 2017년 2월 25일 제 1장 '효시편'이 처음으로 개봉하고 제 2장인 '발진편'은 6월 24일 개봉하였으며 제 3장 '순애편'은 10월 21일 공개 예정.
감독은 전작 이즈부치 유타카가 아니라 창궁의 파프너 시리즈로 유명한 하바라 노부요시. 시리즈 구성은 기동전사 건담 UC의 작가이자 하록 선장의 리메이크인 캡틴 하록의 각본을 썼던 후쿠이 하루토시가 맡게 되었다.
그리고 이번편에는 우주전함 야마토 시리즈 최초로 미국 수출명인 STAR BLAZER가 붙었다.