진정한 악당이 되길 꿈꾸는 닥터 호러블. 하지만 그의 숙적인 캡틴 해머에게 매번 지기만 하고, 평소에는 숫기도 자신감도 없는지라 좋아하는 페니에게 말도 걸지 못한다. 우연찮은 사고로 페니와 캡틴 해머가 만나 연인이 되자, 닥터 호러블은 진정한 악당이 되기 위한 작전을 실행한다.