오랜 애증을 간직한 초능력자 남매들. 그들이 아버지의 죽음 뒤에 도사린 거대한 비밀을 감지한다. 다가오는 종말, 인류의 운명을 위해 엄브렐러 아카데미가 다시 뭉친다.

모두 어디로 간 걸까. 1960년대 댈러스에서 뿔뿔이 흩어진 남매들. 하는 수 없지, 일단은 살아가는 수밖에. 하지만 파멸이 다가오고 있다. 그들은 서로를 찾아야 한다.

다시 아카데미로 돌아온 엄브렐러 남매들. 낯선 하그리브스 남매 집단과 충돌을 벌이는데. 밖에서는 정체를 알 수 없는 힘이 도시를 파괴하기 시작한다.

리셋이 일어나고 6년 후, 초능력을 상실한 하그리브스 남매들은 한 비밀 단체와 마주하게 된다. 그리고 우주에 대한 가장 강력한 위협이 어쩌면 자신들일지도 모른다는 사실을 알게 된다.