지구에 나타난 거대한 외계 물체. 그 물체가 미지의 항성으로 신호를 보내고 있다. 저 우주 어딘가에 외계인이 존재하는 걸까. 우주선 살바레호가 그 비밀을 찾아 떠난다.

한순간에 행성 하나를 파괴한 외계인. 살바레호 대원들에게 평화 협상을 제안한다. 그러나 외계인의 잔인한 만행을 목격하고도 이들을 믿을 수 있을까. 전원 전투태세에 돌입하라, 적색경보다!