먼 미래, 바이러스가 인류를 파괴하고 살아남은 이들은 더이상 앞을 볼 수 없다. 수 세기 후, 바바 보스는 앞을 볼 수 있는 능력을 지닌 쌍둥이의 아버지가 된다. 시력은 저주받은 힘이라며 집요하게 쌍둥이를 제거하려 하는 강력한 여왕에 맞서 부족을 지켜야 한다.

바바 보스는 가족의 재결합을 위해 고투한다. 소원해진 형제 에도는 자신의 형제에 대한 복수를 다짐하며 바바의 딸 하니와를 포로로 잡았다. 한편 파야 왕국과 트리반티안 공화국 사이에 전쟁의 암운이 드리우고, 바바와 가족은 싸움의 한복판으로 끌려들어 간다.

바바 보스가 형제이자 적수인 이도를 물리치고 가족에게 작별을 고한 뒤 숲속에 은둔한 지 약 1년 후를 그린다. 트리반티스의 과학자가 파괴적인 신무기를 개발해 인류의 미래를 위협하고, 바바는 부족을 지키기 위해 파야로 다시 돌아온다.