은하제국의 붕괴를 예측한 수학자 하리 셀던은 인류 문명을 구하기 위해 ‘파운데이션’이라는 지식 저장소를 건설하지만, 클론 황제들이 이끄는 제국의 위협과 내부의 음모, 그리고 예기치 못한 신비에 맞서야 한다.

시즌 1 피날레의 사건이 있은 지 1세기가 넘었을 때, 은하계 곳곳에 긴장이 고조됩니다. 지배 왕조가 풀리기 시작하면서, 젊은 여왕이 복수를 계획합니다. 한편, 특별한 능력을 가진 사람들의 식민지는 새로운 위협이 됩니다. 그리고 그것은 모두 전쟁을 위한 충돌 경로로 이어집니다.

이제 제국은 쇠퇴하고 파운데이션은 수백 개 행성을 통제하는 강대 세력으로 성장했다. 그러던 중 ‘뮤울(The Mule)’이라는 정신 조종력을 지닌 전쟁 군주가 등장해 은하계를 위협한다. 클론 황제들과 파운데이션 양측은 불안한 동맹을 맺으며, 제3 위기(Third Crisis)가 다가오는 가운데, 인류의 운명을 건 사투가 펼쳐진다.