디지몬 세계의 평화를 지켜라! 7명의 어린이와 일곱 디지몬이 뭉쳤다!1999년 8월 1일. 여름방학을 맞아 캠프를 떠난 신태일, 매튜, 한소라, 장한솔, 이미나, 정석, 리키는 갑자기 일어난 눈보라를 피해, 다른 아이들과 떨어져 산 속 대피소에 숩게된다. 대피소 밖으로 나온 후에도 이상현상은 계속되고, 오로라와 함께 하늘에서 수수께끼의 기계가 떨어진다. 알 수 없는 힘으로 생긴 폭포에 휘말린 일곱 아이들은 디지몬 월드에서 깨어나고 그곳에는 일곱 마리의 어린 디지몬들이 아이들을 기다리고 있었는데……. 일곱 아이들과 그들의 파트너 디지몬의 길고도 짧은 여름은 그렇게 시작되었다.

1999년의 모험으로부터 3년이 지난 후인 2002년, 디지몬 세계는 '디지몬 카이저'라는 소년에게 지배당했다. 디지몬 카이저는 진화를 억제하는 어둠의 탑과 디지몬을 조종할 수 있는 검은 고리를 사용해서 디지몬들을 제멋대로 부려먹었고, 새롭게 선택받은 아이들이 이전의 선택받은 아이들인 선배들의 도움을 받으며 디지몬 카이저와 맞서 싸운다. 디지몬 카이저의 소굴에 쳐들어간 산해 일행은 강대한 키메라몬의 힘 앞에 위기를 맞이하지만, 카이저의 파트너 디지몬인 추추몬이 망가지는 카이저를 더 이상 참지 못하고 매그너몬을 구해낸 뒤 자신의 에너지를 넘겨주고 사망한다. 본모습인 서정우로 되돌아온 카이저는 슬퍼하며 현실 세계로 돌아와 힘없이 과거 형이 살아있을 때 상황을 회상한다. 그리고 다시 디지몬 세계로 가서 행복의 마을에서 부활한 추추몬과 재회하고 형에게 품은 집착을 버리고 완전히 개심하여 예전 모습으로 돌아오게 된다.